1.頻率的選擇，超聲清洗機的頻率從28 kHz 到 120kHz 之間，應該使用水或者是水清洗劑，這樣由空穴作用引起的物理清洗力顯然會對低頻有利。但是一般情況下我們會使用 28-40kHz 左右，因為對產品的狹縫、小間隙、深孔的零件清洗會比較好用，如果用40kHz 以上高頻情況會更好。若用寬帶調頻清洗，那么效果將達到較好的水平。
2.功率的選擇 ，工業超聲波清洗機的效果不一定要與功率成正比，可能有時的用小功率，花費的時間很長但是也沒有清除干凈污垢。如果功率達到一定的數值，可能將會很快的將污垢去除。若選擇的功率太大，空化強度會大大的增加，這樣清洗效果是提高了，但精密的零件會產生蝕點，這樣就得不償失了。如果采用三氯乙烯等有機溶劑時，基本上就沒有問題了，采用水或者是水溶性清洗液，容易受到水點的腐蝕，要是振動的板表面受到傷痕，強功率下水底產生的空化腐蝕將更嚴重，所以要按實際使用情況選擇超聲功率。
3.清洗液溫度的選擇， 超聲波清洗機廠家建議用水或者是水清洗液適宜的清洗，溫度應該在 40-60℃左右，在天冷時若清洗液溫度低空化效應差，清洗效果也會變差。所以有部分清洗機在清洗缸外邊繞上加熱電熱絲進行溫度控制。溫度升高后空化就容易發生，因此清洗效果會更好。
4.清洗件處理，工業超聲波清洗機需要考慮因素是清洗件的上，下料，放置清洗件的工裝的設計。清洗件在超聲清洗槽內的時候，無論是清洗件還是清洗件籃都不能觸及槽底。清洗件總的橫截面積不應該超過橫截面積的 70% 。絕緣的清洗件也應該引起特別的注意。工裝籃設計的不當，或者是所盛工件太重，即使是很好的超聲清洗系統，這樣效率也會被大大的降低。
5.清洗零件的位置的確定 ，一般的清洗液液面會高于振動子表面 100mm 以上為理想狀態。由于單頻清洗機受駐波場的影響，波節處振幅就會很小。但是波幅處振幅大造成清洗不均勻，因此較合適選擇清洗物品位置應放在波幅處。
另外超聲波頻率也是決定清洗效果的一種因素，一般市面上的28KHz-128KHz之間的超聲波清洗設備主要是用在清洗流水線上，這個清洗時間又得看清洗工序有幾個，如果選擇全自動超聲波清洗機來進行整個清洗工序，那也是一個長期可行的辦法，這樣是比人工清洗的效率更高，清洗潔凈程度也相對會更干凈。而40KHz以下的換能器主要用于五金類、金屬類的一些零配件，比較廣泛的被應用于鐵道行業、航天航空、輪船、汽車等行業，這些行業零配件往往污垢油脂比較厚重、外表比較粗糙，所以需要強度比較大的低頻換能器，清洗時間普遍是20-30分鐘左右。而一些精密光學零件都是采用高頻換能器，高頻的超聲波清洗機價格比低頻的價格是相對比較高的。像實驗室、醫學研究等場所，其清洗物件都比較精密細致，震動強度不宜太大，一般選擇40KHz或者更高頻率的超聲波清洗機，一般是5-30分鐘不等的清洗時間。
再者洗凈時間的長短還與清洗劑有關，對于一些化學污垢，需要添加清洗劑來產生化學反應，從而達到*清洗，如果清洗劑選的不對，超聲波清洗機運作到報廢也洗不干凈的。所以清洗不干凈一般也不是超聲波清洗機的錯，畢竟超聲波清洗機起到的只是物理上的清洗作用。
